1886年 　東京府牛込区（現在の新宿区）に陸軍軍医の藤田嗣章と政の次男として生まれる。
1905年　19歳　東京美術学校西洋画科に入字。
1907年　21歲　白馬会第11回展に初入選。
1910年　24歲　東京美術学校を卒業。
1912年　26歳　鴇田とみと結婚。
1913年　27歳　父と3年の約束でフランスへ留学。パリのモンパルナスに住む。
1914年　28歲　第一次世界大戦が勃発。日本からの仕送りが途絶え貧窮する。ピカソのアトリエで観たルソーの作品に影響を受ける。
1916年　30歳　父に留学継続のため自活を宣言する。とみと離婚。
1917年　31歳　フェルナンド・バレーと結婚。初の個展を開催。
1918年　32歳　モディリアーニらと南仏に滞在。
1919年　33歳　サロン・ドートンヌに出品した6点がすべて入選。
1922年　36歳　前年に制作したく自画像＞をベルギー王室美術館が買上げる。＜ジュイ布のある裸婦＞を第15回サロン・ドートンヌに出品。
1924年　38歳　フェルナンドと別れ、リュシー・バドゥ（通称ユキ）と暮らし始める。
1925年　39歳　フランスからレジオン・ドヌール勲章（シュバリエ）、ベルギーからレオポルドー世勲章を受章。
1929年　43歳　ユキと結婚。日本へ帰国し国内を旅する。
1930年　44歳　アメリカを経由しパリへ戻る。
1931年　45歳　ユキと離別し、マドレーヌ・ルクーと結婚。ブラジルへ旅立つ。満州事変が起きる。この年から33年まで中南米をめぐる。
1933年　47歳　アメリカ経由で日本へ帰国。
1936年　50歳　マドレーヌが日本で急逝。
1937年　51歳　秋田で大壁画＜秋田の行事＞制作。
1938年　52歳　堀内君代と結婚。海軍嘱託となり、漢口攻撃戦に従軍する。
1939年　53歳　アメリカ経由でフランスに旅立つ。
1940年　54歳　第27回二科展にく争闘（猫）＞が特別陳列。戦況悪化のため再び日本に戻る。
1942年　56歳　陸軍省と海軍省から派遣画家に選ばれ、海外で戦線取材を続ける。
1945年　59歳　疎開先の小淵村（現・相模原市）で終戦を迎える。
1946年　60歳　美術界における戦争責任の問題から戦争犯罪者としてフジタの名前が挙がる。
1949年　63歳　アメリカ入国のビザを得て、ニューヨークに渡る。＜ラ・フォンテーヌ頌＞、＜カフェにて＞を制作（～63年）。
1950年　64歳　フランス入国許可が下り、パリへ戻る。
1955年　69歳　君代夫人とともにフランス国籍を取得。日本芸術院会員を辞任する。
1957年　71歳　レジオン・ドヌール勲章（オフィシエ）受章。
1958年　72歳　ベルギー王立アカデミー会員となる
1959年　73歳　君代夫人とともにカトリックの洗礼を受ける（洗礼名レオナール）。＜聖母子＞に初めて「レオナール・フジタ」とサインする。
1961年　75歳　パリ南部のヴィリエール＝バクルに転居。農家を改装し住居兼アトリエとする。
1966年　80歳　ノートル=ダム・ド・ラ・ペ礼拝堂の建設。建築案から装飾までを手掛ける。
1968年　　　　チューリッヒ州立病院で死去（享年81）。ランス大聖堂で葬儀。日本政府から勲一等瑞宝章を授与される。